Od 2007 armatorzy prowadzący działalność polegającą na świadczeniu usług w żegludze międzynarodowej, z wykorzystaniem statków o pojemności brutto powyżej 100 GT każdy, mogą dokonać wyboru zasad opodatkowania podatkiem dochodowym.

Mogą wybrać podatek tonażowy. 1 stycznia 2007r. wchodzi w życie ustawa z dnia 24 sierpnia 2006r. o podatku tonażowym (Dz. U. Nr 183, poz. 1353), która reguluje opodatkowanie podatkiem tonażowym niektórych dochodów (przychodów) osiąganych przez armatorów eksploatujących morskie statki handlowe w żegludze międzynarodowej.

Dochody opodatkowane podatkiem tonażowym - z woli podatnika - nie podlegają opodatkowaniu podatkiem dochodowym od osób fizycznych czy ryczałtem ewidencjonowanym.

Opodatkowanie podatkiem tonażowym jednego z małżonków wyłącza możliwość wspólnego rozliczenia dochodów w podatku dochodowym PIT. Opodatkowanie podatkiem tonażowym rodzica lub dziecka wyłącza możliwość rozliczenia się rodzica w podatku PIT jako osoby samotnie wychowującej dziecko.

Podatnik może prowadzić działalność opodatkowaną podatkiem tonażowym wraz z innymi rodzajami działalności, opodatkowanymi na innych zasadach. W takich wypadkach obowiązują go szczególne zasady księgowości.

Uwaga ! Komu się opłaca
Podatek zryczałtowany jest niezależny od przychodu czy zysku z działalności, zależy jedynie od tonażu statku oraz okresu, w jakim statek wpisany jest do polskiego rejestru. Minister Gospodarki Morskiej stwierdził, że podatek ten oznacza duże oszczędności dla podatników, jednak warto zauważyć, że podatek tonażowy płatny jest również wtedy, gdy działalność przynosi straty, a także w czasie urlopów. Podatek tonażowy opłaca się tym, którzy osiągają dochód wystarczająco duży, aby podatek tonażowy był niższy, niż podatek płacony na innych zasadach.